Link to NCBI Front Page Taxonomy Logo
Entrez PubMed Nucleotide Protein Genome Structure PMC Taxonomy BioCollections
   
Taxonomy browser (Taeniopygia guttata)

Taeniopygia guttata

Taxonomy ID: 59729 (for references in articles please use NCBI:txid59729)
current name
Taeniopygia guttata (Vieillot, 1817)
homotypic synonym:
Poephila guttata
Taenopygia guttata
Genbank common name: zebra finch
NCBI BLAST name: birds
Rank: species
Genetic code: Translation table 1 (Standard)
Mitochondrial genetic code: Translation table 2 (Vertebrate Mitochondrial)
Lineage( full )
cellular organisms; Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa; Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata; Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi; Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha; Tetrapoda; Amniota; Sauropsida; Sauria; Archelosauria; Archosauria; Dinosauria; Saurischia; Theropoda; Coelurosauria; Aves; Neognathae; Passeriformes; Passeroidea; Estrildidae; Estrildinae; Taeniopygia
   Entrez records   
Database name Direct links
Nucleotide 163,116
Protein 45,204
Structure 3
Genome 1
Popset 105
GEO Datasets 1,764
PubMed Central 3,334
Gene 34,704
SRA Experiments 2,476
Protein Clusters 12
Identical Protein Groups 35,101
BioProject 106
BioSample 1,635
Assembly 25
Taxonomy 1

Genome Information

Go to NCBI genomic BLAST page for Taeniopygia guttata
Genome view: 35 chromosomes
Names 1 1A 1B 2 3 4 4A 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 LGE22 LG2 LG5 Z

External Information Resources (NCBI LinkOut)

LinkOut Subject LinkOut Provider
2 records from this provider taxonomy/phylogenetic Arctos Specimen Database
DNA barcoding : Taeniopygia guttata taxonomy/phylogenetic Barcodes of Life
dryaddb supplemental materials Dryad Digital Repository
GOLD: Go0003070 organism-specific Genomes On Line Database
Show Biotic Interactions taxonomy/phylogenetic Global Biotic Interactions
Related Immune Epitope Information gene/protein/disease-specific Immune Epitope Database and Analysis Resource
Taeniopygia guttata (Vieillot, 1817) taxonomy/phylogenetic Integrated Taxonomic Information System
zebra finch (BAC proposal) taxonomy/phylogenetic NHGRI genome proposal white papers
OMA taxonomy/phylogenetic OMA Browser: Orthologous MAtrix
Poephila guttata taxonomy/phylogenetic TreeBase
WebScipio: Taeniopygia guttata organism-specific WebScipio - eukaryotic gene identification
diArk: Taeniopygia guttata organism-specific diArk - a resource for eukaryotic genome research
Wikipedia taxonomy/phylogenetic iPhylo
Notes:
Groups interested in participating in the LinkOut program should visit the LinkOut home page.
A list of our current non-bibliographic LinkOut providers can be found here.

Information from sequence entries

Organism modifiers

To hide organism modifiers click here
isolate
11 [1 1] 14 [1 1] 183_1 [1 1 1] 183_2 [1 1 1]
184_1 [1 1 1] 184_2 [1 1 1] 185_1 [1 1 1] 185_2 [1 1 1]
186_1 [1 1 1] 186_2 [1 1 1] 187_1 [1 1 1] 187_2 [1 1 1]
188_1 [1 1 1] 188_2 [1 1 1] 189_1 [1 1 1] 189_2 [1 1 1]
256_1 [1 1 1] 256_2 [1 1 1] 259_1 [1 1 1] 259_2 [1 1 1]
260_1 [1 1 1] 260_2 [1 1 1] 267_1 [1 1 1] 267_2 [1 1 1]
269_1 [1 1 1] 269_2 [1 1 1] 7 [1 1] 96.o276 [2 2 2]
A1M [1 1 1] A1M_1 [1 1 1] A1M_2 [1 1 1] A2M [1 1 1]
A2M_1 [1 1 1] A2M_2 [1 1 1] AS10 [1 1 1] AS10_1 [1 1 1]
AS10_2 [1 1 1] AS25 [1 1 1] AS25_1 [1 1 1] AS25_2 [1 1 1]
B29_1 [1 1 1] B29_2 [1 1 1] B30 [1 1 1] B30_1 [1 1 1]
B30_2 [1 1 1] Bird 11 [2 2 2] Bird 12 [3 3 3] Bird 14 [2 2 2]
Bird 15 [2 2 2] Bird 19 [2 2 2] Bird 2 [2 2 2] Bird 22 [3 2 3]
Bird 23 [1 1 1] Bird 3 [2 2 2] Bird 7 [2 1 2] Black17 [2 14607 78]
Blue55 [6 1 48494 40239 50] CM001 [1 1 1] CM002 [1 1 1] CM003 [1 1 1]
CM004 [1 1 1] CM005 [1 1 1] CM006 [1 1 1] CM007 [1 1 1]
CM008 [1 1 1] CM011 [1 1 1] CM012 [1 1 1] CM013 [1 1 1]
CM014 [1 1 1] CM015 [1 1 1] CM017 [1 1 1] CM019 [1 1 1]
CM020 [1 1 1] CM023 [1 1 1] CM025 [1 1 1] CM026 [1 1 1]
CM027 [1 1 1] CM028 [1 1 1] CM029 [1 1 1] CM030 [1 1 1]
CM032 [1 1 1] CM033 [1 1 1] CM034 [1 1 1] CM035 [1 1 1]
CM036 [1 1 1] CM038 [1 1 1] CM039 [1 1 1] CM040 [1 1 1]
CM041 [1 1 1] CM044 [1 1 1] CM045 [1 1 1] CM047 [1 1 1]
CM048 [1 1 1] CM049 [1 1 1] CM052 [1 1 1] CM053 [1 1 1]
CM054 [1 1 1] CM056 [1 1 1] CM057 [1 1 1] CM058 [1 1 1]
CM059 [1 1 1] CM060 [1 1 1] CM061 [1 1 1] CM062 [1 1 1]
CM063 [1 1 1] CM064 [1 1 1] CM065 [1 1 1] CM066 [1 1 1]
CM067 [1 1 1] CM068 [1 1 1] CM069 [1 1 1] CM070 [1 1 1]
CM071 [1 1 1] CM072 [1 1 1] CM073 [1 1 1] CM074 [1 1 1]
CM075 [1 1 1] CM076 [1 1 1] CM077 [1 1 1] CM078 [1 1 1]
CM079 [1 1 1] CM080 [1 1 1] CM081 [1 1 1] CM082 [1 1 1]
CM083 [1 1 1] CM084 [1 1 1] CM085 [1 1 1] CM086 [1 1 1]
CM087 [1 1 1] CM088 [1 1 1] CM089 [1 1 1] CM090 [1 1 1]
CM091 [1 1 1] CM092 [1 1 1] CM093 [1 1 1] CM094 [1 1 1]
CM095 [1 1 1] CM096 [1 1 1] CM097 [1 1 1] CM098 [1 1 1]
CM099 [1 1 1] CM101 [1 1 1] CM102 [1 1 1] CM103 [1 1 1]
CM104 [1 1 1] CM105 [1 1 1] CM106 [1 1 1] CM107 [1 1 1]
CM108 [1 1 1] CM109 [1 1 1] CM110 [1 1 1] CM111 [1 1 1]
CM112 [1 1 1] CM113 [1 1 1] CM115 [1 1 1] CM116 [1 1 1]
CM117 [1 1 1] CM118 [1 1 1] CM119 [1 1 1] CM120 [1 1 1]
CM121 [1 1 1] CM122 [1 1 1] CM123 [1 1 1] CM124 [1 1 1]
CM125 [1 1 1] CM126 [1 1 1] CM127 [1 1 1] CM128 [1 1 1]
CM129 [1 1 1] CM130 [1 1 1] CM131 [1 1 1] CM132 [1 1 1]
CM133 [1 1 1] CM134 [1 1 1] CM135 [1 1 1] CM136 [1 1 1]
CM137 [1 1 1] CM138 [1 1 1] CM139 [1 1 1] CM140 [1 1 1]
CM141 [1 1 1] CM142 [1 1 1] CM143 [1 1 1] CM144 [1 1 1]
CM145 [1 1 1] CM146 [1 1 1] CM147 [1 1 1] CM148 [1 1 1]
CM149 [1 1 1] CM150 [1 1 1] CM151 [1 1 1] CM152 [1 1 1]
CM153 [1 1 1] CM154 [1 1 1] CM155 [1 1 1] CM156 [1 1 1]
CM157 [1 1 1] CM158 [1 1 1] CM159 [1 1 1] CM160 [1 1 1]
CM161 [1 1 1] CM162 [1 1 1] CM163 [1 1 1] CM164 [1 1 1]
CM165 [1 1 1] CM166 [1 1 1] CM167 [1 1 1] CM168 [1 1 1]
CM169 [1 1 1] CM170 [1 1 1] CM171 [1 1 1] CM172 [1 1 1]
CM173 [1 1 1] CM179 [1 1 1] CM183 [1 1 1] CM190 [1 1 1]
CM191 [1 1 1] CM192 [1 1 1] CM198 [1 1 1] CM199 [1 1 1]
CM200 [1 1 1] CM219 [1 1 1] CM220 [1 1 1] CM221 [1 1 1]
CM222 [1 1 1] CM223 [1 1 1] CM230 [1 1 1] CM231 [1 1 1]
CM232 [1 1 1] CM233 [1 1 1] CM234 [1 1 1] CM243 [1 1 1]
CM244 [1 1 1] CM245 [1 1 1] CM246 [1 1 1] CM247 [1 1 1]
CM248 [1 1 1] CM249 [1 1 1] CM250 [1 1 1] CM251 [1 1 1]
CM252 [1 1 1] CM253 [1 1 1] CM254 [1 1 1] CM255 [1 1 1]
CM256 [1 1 1] CM257 [1 1 1] CM258 [1 1 1] CM259 [1 1 1]
CM260 [1 1 1] CM261 [1 1 1] CM268 [1 1 1] CM269 [1 1 1]
CM270 [1 1 1] CM271 [1 1 1] CM274 [1 1 1] CM275 [1 1 1]
CM276 [1 1 1] CM279 [1 1 1] CM280 [1 1 1] CM281 [1 1 1]
CM284 [1 1 1] CM285 [1 1 1] CM286 [1 1 1] CM287 [1 1 1]
CM288 [1 1 1] CM290 [1 1 1] CM291 [1 1 1] CM292 [1 1 1]
CM293 [1 1 1] CM294 [1 1 1] CM295 [1 1 1] CM296 [1 1 1]
CM297 [1 1 1] CM298 [1 1 1] CM301 [1 1 1] CM302 [1 1 1]
CM303 [1 1 1] CM304 [1 1 1] CM305 [1 1 1] CM306 [1 1 1]
CM307 [1 1 1] CM308 [1 1 1] CM309 [1 1 1] CM310 [1 1 1]
CM313 [1 1 1] CM314 [1 1 1] CM315 [1 1 1] CM316 [1 1 1]
CM322 [1 1 1] CM323 [1 1 1] CM325 [1 1 1] CM326 [1 1 1]
CM327 [1 1 1] CM328 [1 1 1] CM329 [1 1 1] CM330 [1 1 1]
CM331 [1 1 1] CM332 [1 1 1] CM333 [1 1 1] CM334 [1 1 1]
CM335 [1 1 1] CM338 [1 1 1] CM339 [1 1 1] CM340 [1 1 1]
CM341 [1 1 1] CM342 [1 1 1] CM343 [1 1 1] CM344 [1 1 1]
CM345 [1 1 1] CM346 [1 1 1] DG13 [1 1 1] DG13_1 [1 1 1]
DG13_2 [1 1 1] DG19_1 [1 1 1] DG19_2 [1 1 1] ECU001_1 [1 1 1]
ECU001_2 [1 1 1] ECU002_1 [1 1 1] ECU002_2 [1 1 1] ECU003_1 [1 1 1]
ECU003_2 [1 1 1] ECU004_1 [1 1 1] ECU004_2 [1 1 1] ECU1 [1 1 1]
ECU3 [1 1 1] ECU4 [1 1 1] FC17 [1 1 1] FC17_1 [1 1 1]
FC17_2 [1 1 1] FC19_1 [1 1 1] FC19_2 [1 1 1] HR10_1 [1 1 1]
HR10_2 [1 1 1] HR9 [1 1 1] HR9_1 [1 1 1] HR9_2 [1 1 1]
K11 [1 1 1] K11_1 [1 1 1] K11_2 [1 1 1] K20 [1 1 1]
K20_1 [1 1 1] K20_2 [1 1 1] L1 [3 2 3] L1_1 [1 1 1]
L1_2 [1 1 1] L3_1 [1 1 1] L3_2 [1 1 1] L6_1 [1 1 1]
L6_2 [1 1 1] L7 [1 1 1] L7_1 [1 1 1] L7_2 [1 1 1]
L9 [1 1 1] L9new_1 [1 1 1] L9new_2 [1 1 1] LG21 [1 1 1]
LG21_1 [1 1 1] LG21_2 [1 1 1] LUL01 [3 3] LUL02 [3 3]
LUL03 [3 3] LUL06 [3 3] LUL07 [3 3] LUL09 [3 3]
LUL1 [24 24 1] LUL2 [23 23 1] LUL3 [24 24 1] LUL6 [24 24 1]
LUL7 [23 23 1] LUL9 [22 22 1] LUT01 [3 3] LUT02 [3 3]
LUT03 [3 3] LUT04 [3 3] LUT05 [3 3] LUT06 [3 3]
LUT1 [27 27 4] LUT2 [27 27 4] LUT3 [27 27 4] LUT4 [26 26 3]
LUT5 [22 22 1] LUT6 [21 21] LtG35 [1 1 1] LtG35_1 [1 1 1]
LtG35_2 [1 1 1] LtG36 [1 1 1] LtG36_1 [1 1 1] LtG36_2 [1 1 1]
LtG3839 [1 1 1] LtG3839_1 [1 1 1] LtG3839_2 [1 1 1] M143_1 [1 1 1]
M143_2 [1 1 1] M205 [1 1 1] M205_1 [1 1 1] M205_2 [1 1 1]
M4 [3 2 3] M4_1 [1 1 1] M4_2 [1 1 1] M57 [1 1 1]
M57_1 [1 1 1] M57_2 [1 1 1] M7 [3 2 3] M7_1 [1 1 1]
M7_2 [1 1 1] O3_1 [1 1 1] O3_2 [1 1 1] O5W18 [1 1 1]
O5W18_1 [1 1 1] O5W18_2 [1 1 1] SEL001 [1 1 1] SEL001_1 [1 1 1]
SEL001_2 [1 1 1] SEL002 [1 1 1] SEL002_1 [1 1 1] SEL002_2 [1 1 1]
SEL003 [1 1 1] SEL003_1 [1 1 1] SEL003_2 [1 1 1] SEL004 [1 1 1]
SEL004_1 [1 1 1] SEL004_2 [1 1 1] SEL005 [1 1 1] SEL005_1 [1 1 1]
SEL005_2 [1 1 1] SEL006 [1 1 1] SEL006_1 [1 1 1] SEL006_2 [1 1 1]
SEL007 [1 1 1] SEL007_1 [1 1 1] SEL007_2 [1 1 1] SEL008 [1 1 1]
SEL008_1 [1 1 1] SEL008_2 [1 1 1] SEL12 [1 1 1] SEL12_1 [1 1 1]
SEL12_2 [1 1 1] SEL13 [1 1 1] SEL13_1 [1 1 1] SEL13_2 [1 1 1]
SEL14 [1 1 1] SEL14_1 [1 1 1] SEL14_2 [1 1 1] SR6 [1 1 1]
SR6_1 [1 1 1] SR6_2 [1 1 1] T1 [3 2 3] T1M [1 1 1]
T1M_1 [1 1 1] T1M_2 [1 1 1] T1_1 [1 1 1] T1_2 [1 1 1]
T2 [1 1 1] T2M [1 1 1] T2M_1 [1 1 1] T2M_2 [1 1 1]
T2_1 [1 1 1] T2_2 [1 1 1] T3 [1 1 1] T3M [1 1 1]
T3M_1 [1 1 1] T3M_2 [1 1 1] T3new_1 [1 1 1] T3new_2 [1 1 1]
T4_1 [1 1 1] T4_2 [1 1 1] T5 [1 1 1] T5_1 [1 1 1]
T5_2 [1 1 1] T6 [3 2 3] T6_1 [1 1 1] T6_2 [1 1 1]
TG_A10 [1 1] TG_A11_V1 [1 1] TG_A11_V2 [1 1] TG_D11 [1 1]
TG_c10 [1 1] V3V31_1 [1 1 1] V3V31_2 [1 1 1] W1415 [1 1 1]
W1416_1 [1 1 1] W1416_2 [1 1 1] W35 [1 1 1] W35_1 [1 1 1]
W35_2 [1 1 1] W9_1 [1 1 1] W9_2 [1 1 1] ZFM37 [1 1]
ZeFi1 [7 7 7] ZeFi2 [1 1 1] Zebra finch 1010 [1 1] Zebra finch 1034 [1 1]
Zebra finch 135 [1 1] Zebra finch 250 [2 2] Zebra finch 256 [1 1] Zebra finch 40 [1 1]
Zebra finch 43 [1 1] Zebra finch 84 [1 1] Zebra finch 884 [1 1] Zebra finch 943 [4 4]
Zebra finch 944 [2 2] Zebra finch 945 [1 1] Zebra finch 962 [3 3] Zebra finch 980 [3 3]
Zebra finch 997 [4 4] Zebra finch A134 [1 1] Zebra finch AF [2 2] Zebra finch AM [3 3]
Zebra finch B100 [1 1] Zebra finch BF [3 3] Zebra finch BM [2 2] Zebra finch M37 [2 2]
Zebra finch M43 [1 1] Zebra finch M45 [1 1] ZfMAdThra01 [1 1] individual 3 (C(M)) [1]
individual B095 [1] mcz184 [1 1 1] mcz185 [1 1 1] mcz187 [1 1 1]
mcz188 [1 1 1] mcz189 [1 1 1] mcz190 [1 1 1] mcz267 [1 1 1]
mcz268 [1 1 1] mcz269 [1 1 1] mcz270 [1 1 1] mcz271 [1 1 1]
taegu179 [1 1] yellowbeak [1 1 1]
specimen-voucher
MAG de Bakker ZVS10 (IBL) [1 1 1] MCZ183 [2 27 2] MCZ184 [3 30 3] MCZ185 [3 30 3]
MCZ186 [2 31 2] MCZ187 [3 31 3] MCZ188 [3 29 3] MCZ189 [3 28 3]
MCZ190 [1 28 1] MCZ256 [2 29 2] MCZ259 [2 31 2] MCZ260 [2 30 2]
MCZ267 [3 31 3] MCZ268 [1 30 1] MCZ269 [3 31 3] MCZ270 [1 28 1]
MCZ271 [1 27 1] UMMZ 96.o276 [2 2 2] UWBM:57528 [1 4 1] UWBM:60818 [3 3]
VAL 004 [1 1] VAL 005 [1 1] ZCU:2014C00009 [3 3 3] ZF01 [2 2 2]
breed
domestic [96 24 3 24 96] zebra finch [4 1]

Disclaimer: The NCBI taxonomy database is not an authoritative source for nomenclature or classification - please consult the relevant scientific literature for the most reliable information.

Reference: How to cite this resource - Schoch CL, et al. NCBI Taxonomy: a comprehensive update on curation, resources and tools. Database (Oxford). 2020: baaa062. PubMed: 32761142 PMC: PMC7408187.


Comments and questions to info@ncbi.nlm.nih.gov

[Help] [Search] [NLM NIH] [Disclaimer]