NCBI Logo
GEO Logo
   NCBI > GEO > Accession DisplayHelp Not logged in | LoginHelp
GEO help: Mouse over screen elements for information.
          Go
Platform GPL11532 Query DataSets for GPL11532
Status Public on Jan 18, 2011
Title [HuGene-1_1-st] Affymetrix Human Gene 1.1 ST Array [transcript (gene) version]
Technology type in situ oligonucleotide
Distribution commercial
Organism Homo sapiens
Manufacturer Affymetrix
Manufacture protocol see manufacturer's web site
 
Description HuGene-1_1-st-v1.na32.hg19.transcript.csv
#%create_date=Tue Jun 21 17:41:46 2011 PDT
#%chip_type=HuGene-1_1-st-v1
#%lib_set_name=HuGene-1_1-st
#%lib_set_version=v1
#%genome-species=Homo sapiens
#%genome-version=hg19
#%genome-version-ucsc=hg19
#%genome-version-ncbi=GRCh37
#%genome-version-create_date=2009-02-00
#%genome-lifted-method=liftOver
#%genome-lifted_from-species=Homo sapiens
#%genome-lifted_from-version-ucsc=hg18
#%genome-lifted_from-version-ncbi=36.1
#%netaffx-annotation-date=2011-06-22
#%netaffx-annotation-netaffx-build=32
 
Web link http://www.affymetrix.com/browse/products.jsp?navMode=34000&productId=131554&navAction=jump&aId=productsNav#1_1
http://www.affymetrix.com/analysis/index.affx
Submission date Jan 18, 2011
Last update date Nov 08, 2016
Organization Affymetrix, Inc.
E-mail(s) geo@ncbi.nlm.nih.gov, support@affymetrix.com
Phone 888-362-2447
URL http://www.affymetrix.com/index.affx
Street address
City Santa Clara
State/province CA
ZIP/Postal code 95051
Country USA
 
Samples (7703) GSM737553, GSM737554, GSM737555, GSM737556, GSM738121, GSM738122 
Series (165)
GSE29753 Gene expression profiles of dental follicle cells after 48 hours of transfection in vitro with a DLX3 plasmid and an empty vector
GSE29770 Transduction of human fibroblasts with Zic3 combined with OCT4, SOX2 and KLF4 induces stable neural progenitor cell lines
GSE31628 Gene expression profiles of DFCs and SHED 48 hours after in vitro transfection with a TP53 plasmid, a SP1 plasmid, or an empty vector.
Relations
Alternative to GPL15640 (Alternative CDF)
Alternative to GPL17555 (alternative)
Alternative to GPL18190 (Alternative CDF [HuGene11stv1_Hs_ENTREZG_15.1.0])
Alternative to GPL16977 (Alternative CDF)
Alternative to GPL20234 (alternative CDF [HuGene11stv1_Hs_ENSG version 18.0.0])
Alternative to GPL20880 (alternative CDF [HuGene11st_Hs_ENTREZG_18.0.0])
Alternative to GPL22286 (alternative CDF [HuGene11stv1_Hs_ENSG version 19.0.0])
Alternative to GPL22654 (alternative CDF [HuGene11stv1_Hs_ENTREZG version 15.1.0]))

Data table header descriptions
ID transcript_cluster_id
GB_LIST GenBank and RefSeq Accessions from mrna_assignment column
SPOT_ID genomic location of the transcript cluster in the version of the genome assembly used at annotation time. Coordinates are standard 1-based (length=stop-start+1).
seqname chromosome number
RANGE_GB NCBI RefSeq for chromosome of current build
RANGE_STRAND strand (+|-)
RANGE_START start (integer). Coordinates are standard 1-based (length=stop-start+1).
RANGE_STOP stop (integer). Coordinates are standard 1-based (length=stop-start+1).
total_probes Total number of probes contained by this transcript cluster.
gene_assignment Gene information for each assigned mRNA for mRNAs that corresponds to known genes (multipart).
mrna_assignment Description of the public mRNAs that should be detected by the sets within this transcript cluster based on sequence alignment (multipart).
category Array design category of the transcript cluster

Data table
ID GB_LIST SPOT_ID seqname RANGE_GB RANGE_STRAND RANGE_START RANGE_STOP total_probes gene_assignment mrna_assignment category
7896736 chr1:53049-54936 chr1 NC_000001.10 + 53049 54936 7 --- --- ---
7896738 chr1:63015-63887 chr1 NC_000001.10 + 63015 63887 31 --- ENST00000328113 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:15:102467008:102467910:-1 gene:ENSG00000183909 // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000318181 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:19:104601:105256:1 gene:ENSG00000176705 // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENST00000492842 // ENSEMBL // cdna:pseudogene chromosome:GRCh37:1:62948:63887:1 gene:ENSG00000240361 // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 main
7896740 NM_001005240, NM_001004195, NM_001005484, BC136848, BC136907 chr1:69091-70008 chr1 NC_000001.10 + 69091 70008 24 NM_001005240 // OR4F17 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 17 // 19p13.3 // 81099 /// NM_001004195 // OR4F4 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 4 // 15q26.3 // 26682 /// NM_001005484 // OR4F5 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 5 // 1p36.33 // 79501 /// ENST00000318050 // OR4F17 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 17 // 19p13.3 // 81099 /// ENST00000335137 // OR4F4 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 4 // 15q26.3 // 26682 /// ENST00000326183 // OR4F5 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 5 // 1p36.33 // 79501 /// BC136848 // OR4F17 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 17 // 19p13.3 // 81099 /// BC136907 // OR4F4 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 4 // 15q26.3 // 26682 /// ENST00000442916 // OR4F17 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 17 // 19p13.3 // 81099 NM_001005240 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 17 (OR4F17), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_001004195 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 4 (OR4F4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_001005484 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 5 (OR4F5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000318050 // ENSEMBL // Olfactory receptor 4F17 gene:ENSG00000176695 // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000335137 // ENSEMBL // Olfactory receptor 4F4 gene:ENSG00000186092 // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000326183 // ENSEMBL // Olfactory receptor 4F5 gene:ENSG00000177693 // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC136848 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 17, mRNA (cDNA clone MGC:168462 IMAGE:9020839), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC136907 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:168521 IMAGE:9020898), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENST00000442916 // ENSEMBL // OR4F4 (Fragment) gene:ENSG00000176695 // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 main
7896742 BC118988, AL137655 chr1:334129-334296 chr1 NC_000001.10 + 334129 334296 6 ENST00000388975 // SEPT14 // septin 14 // 7p11.2 // 346288 /// BC118988 // NCRNA00266 // non-protein coding RNA 266 // --- // 140849 /// AL137655 // LOC100134822 // similar to hCG1739109 // --- // 100134822 ENST00000388975 // ENSEMBL // Septin-14 gene:ENSG00000154997 // chr1 // 50 // 100 // 3 // 6 // 0 /// BC118988 // GenBank // Homo sapiens chromosome 20 open reading frame 69, mRNA (cDNA clone MGC:141807 IMAGE:40035995), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// AL137655 // GenBank // Homo sapiens mRNA; cDNA DKFZp434B2016 (from clone DKFZp434B2016). // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000428915 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:10:38742109:38755311:1 gene:ENSG00000203496 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000455207 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:334129:446155:1 gene:ENSG00000224813 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000455464 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:334140:342806:1 gene:ENSG00000224813 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000440200 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:536816:655580:-1 gene:ENSG00000230021 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000279067 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:20:62921738:62934912:1 gene:ENSG00000149656 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000499986 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:5:180717576:180761371:1 gene:ENSG00000248628 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000436899 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:6:131910:144885:-1 gene:ENSG00000170590 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000432557 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:8:132324:150572:-1 gene:ENSG00000250210 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000523795 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:8:141690:150563:-1 gene:ENSG00000250210 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000490482 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:8:149942:163324:-1 gene:ENSG00000223508 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000307499 // ENSEMBL // cdna:known supercontig::GL000227.1:57780:70752:-1 gene:ENSG00000229450 // chr1 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000441245 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:637316:655530:-1 gene:ENSG00000230021 // chr1 // 100 // 67 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000425473 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:20:62926294:62944485:1 gene:ENSG00000149656 // chr1 // 100 // 67 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000471248 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:110953:129173:-1 gene:ENSG00000238009 // chr1 // 75 // 67 // 3 // 4 // 0 main
7896744 NM_001005277, NM_001005221, NM_001005224, NM_001005504, BC137547 chr1:367659-368597 chr1 NC_000001.10 + 367659 368597 36 NM_001005277 // OR4F16 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 16 // 1p36.33 // 81399 /// NM_001005221 // OR4F29 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 29 // 1p36.33 // 729759 /// NM_001005224 // OR4F3 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3 // 5q35.3 // 26683 /// NM_001005504 // OR4F21 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 21 // 8p23.3 // 441308 /// ENST00000320901 // OR4F21 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 21 // 8p23.3 // 441308 /// BC137547 // OR4F3 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3 // 5q35.3 // 26683 /// BC137547 // OR4F16 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 16 // 1p36.33 // 81399 /// BC137547 // OR4F29 // olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 29 // 1p36.33 // 729759 NM_001005277 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 16 (OR4F16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_001005221 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 29 (OR4F29), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_001005224 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3 (OR4F3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_001005504 // RefSeq // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 21 (OR4F21), mRNA. // chr1 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// ENST00000320901 // ENSEMBL // Olfactory receptor 4F21 gene:ENSG00000176269 // chr1 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// BC137547 // GenBank // Homo sapiens olfactory receptor, family 4, subfamily F, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:169170 IMAGE:9021547), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000426406 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:367640:368634:1 gene:ENSG00000235249 // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000332831 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:621096:622034:-1 gene:ENSG00000185097 // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000456475 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:5:180794269:180795263:1 gene:ENSG00000230178 // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENST00000521196 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:11:86612:87605:-1 gene:ENSG00000224777 // chr1 // 78 // 100 // 28 // 36 // 0 main
7896746 NC_001807, AK074482 chr1:564951-565019 chr1 NC_000001.10 + 564951 565019 28 --- NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:4403-4470; gene=TRNM; product=tRNA-Met // chr1 // 78 // 96 // 21 // 27 // 0 /// AK074482 // GenBank // Homo sapiens cDNA fis, A-BNGH41000020, highly similar to Homo sapiens isolate EIJbIII-4-94 NADH dehydrogenase subunit 1 gene; mitochondrial gene for mitochondrial product. // chr1 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// ENST00000467964 // ENSEMBL // ncrna_pseudogene:Mt_tRNA_pseudogene chromosome:GRCh37:17:22025157:22025224:1 gene:ENSG00000240259 // chr1 // 26 // 96 // 7 // 27 // 1 /// ENST00000468070 // ENSEMBL // ncrna_pseudogene:Mt_tRNA_pseudogene chromosome:GRCh37:2:140977938:140978003:-1 gene:ENSG00000240717 // chr1 // 28 // 64 // 5 // 18 // 1 main
7896748 NC_001807 chr1:566062-566129 chr1 NC_000001.10 + 566062 566129 24 --- NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:5513-5580; gene=TRNW; product=tRNA-Trp // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 main
7896750 NC_001807, AK172782 chr1:568069-568136 chr1 NC_000001.10 + 568069 568136 28 AK172782 // GPAM // glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial // 10q25.2 // 57678 NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:7519-7586; gene=TRND; product=tRNA-Asp // chr1 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// AK172782 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ23943 fis, clone HEP04035, highly similar to Glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial precursor (EC 2.3.1.15). // chr1 // 100 // 25 // 7 // 7 // 0 main
7896752 NC_001807, M37726 chr1:568844-568913 chr1 NC_000001.10 + 568844 568913 24 --- NC_001807 // GenBank // gi|17981852|ref|NC_001807.4|:8296-8365; gene=TRNK; product=tRNA-Lys // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// M37726 // GenBank // Human mitochondrial Lys-tRNA-aaa. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 main
7896754 AK290103, AK026836, AK124970 chr1:721406-721912 chr1 NC_000001.10 + 721406 721912 23 AK290103 // LOC100287934 // hypothetical LOC100287934 // 1p36.33 // 100287934 /// ENST00000358533 // LOC100287934 // hypothetical LOC100287934 // 1p36.33 // 100287934 AK290103 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ78588 complete cds. // chr1 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// ENST00000358533 // ENSEMBL // Transmembrane protein FLJ78588 gene:ENSG00000197049 // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK026836 // GenBank // Homo sapiens cDNA: FLJ23183 fis, clone LNG11477. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AK124970 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ42980 fis, clone BRTHA2006735. // chr1 // 100 // 17 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000449219 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:224183659:224197405:1 gene:ENSG00000185495 // chr1 // 100 // 17 // 4 // 4 // 0 main
7896756 BC037297, BC118644 chr1:752751-755214 chr1 NC_000001.10 + 752751 755214 26 BC037297 // FAM87A // family with sequence similarity 87, member A // 8p23.3 // 157693 BC037297 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:4821387. // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENST00000330148 // ENSEMBL // hypothetical protein gene:ENSG00000182366 // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENST00000523195 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:8:326043:333174:-1 gene:ENSG00000182366 // chr1 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// BC118644 // GenBank // Homo sapiens cDNA clone IMAGE:40030978. // chr1 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 main
7896759 AK096570 chr1:791391-793751 chr1 NC_000001.10 + 791391 793751 12 AK096570 // LOC643837 // hypothetical LOC643837 // 1p36.33 // 643837 AK096570 // GenBank // Homo sapiens cDNA FLJ39251 fis, clone OCBBF2008701. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 main
7896761 NM_152486, NM_015658, BC024295 chr1:860530-880512 chr1 NC_000001.10 + 860530 880512 42 NM_152486 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// NM_015658 // NOC2L // nucleolar complex associated 2 homolog (S. cerevisiae) // 1p36.33 // 26155 /// ENST00000342066 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// ENST00000327044 // NOC2L // nucleolar complex associated 2 homolog (S. cerevisiae) // 1p36.33 // 26155 /// BC024295 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// ENST00000443100 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// ENST00000420190 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 /// ENST00000437963 // SAMD11 // sterile alpha motif domain containing 11 // 1p36.33 // 148398 NM_152486 // RefSeq // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11 (SAMD11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NM_015658 // RefSeq // Homo sapiens nucleolar complex associated 2 homolog (S. cerevisiae) (NOC2L), mRNA. // chr1 // 100 // 2 // 2 // 1 // 0 /// ENST00000342066 // ENSEMBL // Isoform 3 of Sterile alpha motif domain-containing protein 11 gene:ENSG00000187634 // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENST00000327044 // ENSEMBL // Nucleolar complex protein 2 homolog gene:ENSG00000188976 // chr1 // 100 // 2 // 2 // 1 // 0 /// BC024295 // GenBank // Homo sapiens sterile alpha motif domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:39333 IMAGE:3354502), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// ENST00000443100 // ENSEMBL // Isoform 2 of Sterile alpha motif domain-containing protein 11 gene:ENSG00000187634 // chr1 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENST00000420190 // ENSEMBL // Sterile alpha motif domain containing 11 gene:ENSG00000187634 // chr1 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000437963 // ENSEMBL // Sterile alpha motif domain containing 11 gene:ENSG00000187634 // chr1 // 100 // 14 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000478729 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:875726:877553:1 gene:ENSG00000187634 // chr1 // 100 // 12 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000466827 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:877483:878182:1 gene:ENSG00000187634 // chr1 // 100 // 10 // 4 // 4 // 0 /// ENST00000464948 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:877546:878272:1 gene:ENSG00000187634 // chr1 // 100 // 10 // 4 // 4 // 0 main
7896779 NM_198317, AY423763 chr1:895967-901099 chr1 NC_000001.10 + 895967 901099 47 NM_198317 // KLHL17 // kelch-like 17 (Drosophila) // 1p36.33 // 339451 /// ENST00000338591 // KLHL17 // kelch-like 17 (Drosophila) // 1p36.33 // 339451 /// AY423763 // KLHL17 // kelch-like 17 (Drosophila) // 1p36.33 // 339451 /// ENST00000455747 // KLHL17 // kelch-like 17 (Drosophila) // 1p36.33 // 339451 NM_198317 // RefSeq // Homo sapiens kelch-like 17 (Drosophila) (KLHL17), mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000338591 // ENSEMBL // Kelch-like protein 17 gene:ENSG00000187961 // chr1 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// AY423763 // GenBank // Homo sapiens actinfilin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000455747 // ENSEMBL // KLHL17 protein gene:ENSG00000187961 // chr1 // 100 // 30 // 14 // 14 // 0 /// ENST00000473277 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:895967:901095:1 gene:ENSG00000187961 // chr1 // 100 // 70 // 33 // 33 // 0 /// ENST00000463212 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:896829:897858:1 gene:ENSG00000187961 // chr1 // 100 // 32 // 15 // 15 // 0 /// ENST00000466300 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:898107:899910:1 gene:ENSG00000187961 // chr1 // 100 // 28 // 13 // 13 // 0 main
7896798 NM_032129, NM_001160184, BC101387 chr1:901877-910488 chr1 NC_000001.10 + 901877 910488 43 NM_032129 // PLEKHN1 // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 // 1p36.33 // 84069 /// NM_001160184 // PLEKHN1 // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 // 1p36.33 // 84069 /// ENST00000379410 // PLEKHN1 // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 // 1p36.33 // 84069 /// ENST00000379407 // PLEKHN1 // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 // 1p36.33 // 84069 /// BC101387 // PLEKHN1 // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 // 1p36.33 // 84069 /// ENST00000379409 // PLEKHN1 // pleckstrin homology domain containing, family N member 1 // 1p36.33 // 84069 NM_032129 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family N member 1 (PLEKHN1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// NM_001160184 // RefSeq // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family N member 1 (PLEKHN1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000379410 // ENSEMBL // Isoform 2 of Pleckstrin homology domain-containing family N member 1 gene:ENSG00000187583 // chr1 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENST00000379407 // ENSEMBL // Isoform 3 of Pleckstrin homology domain-containing family N member 1 gene:ENSG00000187583 // chr1 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// BC101387 // GenBank // Homo sapiens pleckstrin homology domain containing, family N member 1, mRNA (cDNA clone MGC:120616 IMAGE:40026404), complete cds. // chr1 // 95 // 95 // 39 // 41 // 0 /// ENST00000379409 // ENSEMBL // Isoform 1 of Pleckstrin homology domain-containing family N member 1 gene:ENSG00000187583 // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENST00000480267 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:906255:906903:1 gene:ENSG00000187583 // chr1 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000491024 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:908892:911245:1 gene:ENSG00000187583 // chr1 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 main
7896817 NM_005101, M13755 chr1:948803-949920 chr1 NC_000001.10 + 948803 949920 27 NM_005101 // ISG15 // ISG15 ubiquitin-like modifier // 1p36.33 // 9636 /// ENST00000379389 // ISG15 // ISG15 ubiquitin-like modifier // 1p36.33 // 9636 /// M13755 // ISG15 // ISG15 ubiquitin-like modifier // 1p36.33 // 9636 NM_005101 // RefSeq // Homo sapiens ISG15 ubiquitin-like modifier (ISG15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENST00000379389 // ENSEMBL // Ubiquitin-like protein ISG15 gene:ENSG00000187608 // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M13755 // GenBank // Human interferon-induced 17-kDa/15-kDa protein mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 main
7896822 NM_198576, AB191264 chr1:955503-991496 chr1 NC_000001.10 + 955503 991496 49 NM_198576 // AGRN // agrin // 1p36.33 // 375790 /// ENST00000379370 // AGRN // agrin // 1p36.33 // 375790 /// AB191264 // AGRN // agrin // 1p36.33 // 375790 /// ENST00000379364 // AGRN // agrin // 1p36.33 // 375790 /// ENST00000419249 // AGRN // agrin // 1p36.33 // 375790 NM_198576 // RefSeq // Homo sapiens agrin (AGRN), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENST00000379370 // ENSEMBL // Agrin gene:ENSG00000188157 // chr1 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// AB191264 // GenBank // Homo sapiens AGRN mRNA for agrin, complete cds. // chr1 // 98 // 100 // 48 // 49 // 0 /// ENST00000379364 // ENSEMBL // Agrin gene:ENSG00000188157 // chr1 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENST00000419249 // ENSEMBL // Agrin gene:ENSG00000188157 // chr1 // 100 // 12 // 6 // 6 // 0 /// ENST00000461111 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:987366:991492:1 gene:ENSG00000188157 // chr1 // 100 // 20 // 10 // 10 // 0 /// ENST00000479707 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:980779:981729:1 gene:ENSG00000188157 // chr1 // 100 // 10 // 5 // 5 // 0 /// ENST00000469403 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:970247:976777:1 gene:ENSG00000188157 // chr1 // 100 // 6 // 3 // 3 // 0 /// ENST00000466223 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:GRCh37:1:982581:983245:1 gene:ENSG00000188157 // chr1 // 100 // 6 // 3 // 3 // 0 main
7896859 NR_029639 chr1:1102484-1102578 chr1 NC_000001.10 + 1102484 1102578 25 NR_029639 // MIR200B // microRNA 200b // 1p36.33 // 406984 NR_029639 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 200b (MIR200B), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-200b // miRBase Micro RNA Database // MI0000342 Homo sapiens miR-200b stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 main
7896861 NR_029834 chr1:1103243-1103332 chr1 NC_000001.10 + 1103243 1103332 25 NR_029834 // MIR200A // microRNA 200a // 1p36.33 // 406983 NR_029834 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 200a (MIR200A), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// hsa-mir-200a // miRBase Micro RNA Database // MI0000737 Homo sapiens miR-200a stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 main
7896863 NR_029957 chr1:1104373-1104471 chr1 NC_000001.10 + 1104373 1104471 18 NR_029957 // MIR429 // microRNA 429 // 1p36.33 // 554210 NR_029957 // RefSeq // Homo sapiens microRNA 429 (MIR429), microRNA. // chr1 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// hsa-mir-429 // miRBase Micro RNA Database // MI0001641 Homo sapiens miR-429 stem-loop // chr1 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 main

Total number of rows: 33297

Table truncated, full table size 47373 Kbytes.






Download family Format
SOFT formatted family file(s) SOFTHelp
MINiML formatted family file(s) MINiMLHelp

Supplementary data files not provided

| NLM | NIH | GEO Help | Disclaimer | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap