GEO help: Mouse over screen elements for information.
Status
Public on Oct 01, 2008
Title
Rosetta/Merck Mouse 430 2.0 RSTA Custom CDF microarray
Technology type
in situ oligonucleotide
Distribution
custom-commercial
Organism
Mus musculus Manufacturer
Affymetrix
Manufacture protocol
This identical to GPL1261 (Affymetrix GeneChip Mouse Genome 430 2.0 Array) but a custom CDF environment was used to extract data. The custom CDF can be found at the link below.
Description
Oligonucleotide array on glass.
Web link
http://www.rii.com Contributor(s)
Kulkarni A , Castle J Submission date
Sep 24, 2008
Last update date
Oct 01, 2008
Contact name
Amit V Kulkarni
E-mail(s)
amit_kulkarni@merck.com Phone
206-802-7352
Organization name
Rosetta Inpharmatics / Merck Pharmaceuticals
Department
Genomics
Lab
Array Design
Street address
401 Terry Ave N
City
Seattle
State/province
WA
ZIP/Postal code
98109
Country
USA
Samples (872)
GSM329115 , GSM329116 , GSM329117 , GSM329118 , GSM329119 , GSM329120
GSM329121 ,
GSM329122 ,
GSM329123 ,
GSM329124 ,
GSM329125 ,
GSM329126 ,
GSM329127 ,
GSM329128 ,
GSM329129 ,
GSM329130 ,
GSM329131 ,
GSM329132 ,
GSM329133 ,
GSM329134 ,
GSM329135 ,
GSM329136 ,
GSM329137 ,
GSM329138 ,
GSM329139 ,
GSM329140 ,
GSM329141 ,
GSM329142 ,
GSM329143 ,
GSM329144 ,
GSM329145 ,
GSM329146 ,
GSM329147 ,
GSM329148 ,
GSM329149 ,
GSM329150 ,
GSM329151 ,
GSM329160 ,
GSM329161 ,
GSM329162 ,
GSM329163 ,
GSM329164 ,
GSM329165 ,
GSM329166 ,
GSM329167 ,
GSM329168 ,
GSM329169 ,
GSM329170 ,
GSM329171 ,
GSM329172 ,
GSM329173 ,
GSM329174 ,
GSM329175 ,
GSM329176 ,
GSM329177 ,
GSM329178 ,
GSM329179 ,
GSM329180 ,
GSM329181 ,
GSM329182 ,
GSM329183 ,
GSM329184 ,
GSM329185 ,
GSM329186 ,
GSM329187 ,
GSM329188 ,
GSM329189 ,
GSM329190 ,
GSM329191 ,
GSM329192 ,
GSM329193 ,
GSM329194 ,
GSM329203 ,
GSM329204 ,
GSM329205 ,
GSM329206 ,
GSM329207 ,
GSM329208 ,
GSM329209 ,
GSM329210 ,
GSM329211 ,
GSM329212 ,
GSM329213 ,
GSM329214 ,
GSM329215 ,
GSM329216 ,
GSM329217 ,
GSM329218 ,
GSM329219 ,
GSM329220 ,
GSM329221 ,
GSM329222 ,
GSM329223 ,
GSM329224 ,
GSM329225 ,
GSM329226 ,
GSM329227 ,
GSM329228 ,
GSM329229 ,
GSM329230 ,
GSM329231 ,
GSM329232 ,
GSM329233 ,
GSM329234 ,
GSM329235 ,
GSM329236 ,
GSM329237 ,
GSM329238 ,
GSM329239 ,
GSM329240 ,
GSM329241 ,
GSM329242 ,
GSM522729 ,
GSM522730 ,
GSM522731 ,
GSM522732 ,
GSM522733 ,
GSM522734 ,
GSM522735 ,
GSM522736 ,
GSM522737 ,
GSM522738 ,
GSM522739 ,
GSM522740 ,
GSM522741 ,
GSM522742 ,
GSM522743 ,
GSM522744 ,
GSM522745 ,
GSM522746 ,
GSM522747 ,
GSM522748 ,
GSM522749 ,
GSM522750 ,
GSM522751 ,
GSM522752 ,
GSM522753 ,
GSM522754 ,
GSM522755 ,
GSM522756 ,
GSM522757 ,
GSM522758 ,
GSM522759 ,
GSM522760 ,
GSM522761 ,
GSM522762 ,
GSM522763 ,
GSM522764 ,
GSM522765 ,
GSM522766 ,
GSM522767 ,
GSM522768 ,
GSM522769 ,
GSM522770 ,
GSM522771 ,
GSM522772 ,
GSM522773 ,
GSM522774 ,
GSM522775 ,
GSM522776 ,
GSM522777 ,
GSM522778 ,
GSM522779 ,
GSM522780 ,
GSM522781 ,
GSM522782 ,
GSM522783 ,
GSM522784 ,
GSM522785 ,
GSM522786 ,
GSM522787 ,
GSM522788 ,
GSM522789 ,
GSM522790 ,
GSM522791 ,
GSM522792 ,
GSM522793 ,
GSM522794 ,
GSM522795 ,
GSM522796 ,
GSM522797 ,
GSM522798 ,
GSM522799 ,
GSM522800 ,
GSM522801 ,
GSM522802 ,
GSM522803 ,
GSM522804 ,
GSM522805 ,
GSM522806 ,
GSM522807 ,
GSM522808 ,
GSM522809 ,
GSM522810 ,
GSM522811 ,
GSM522812 ,
GSM522813 ,
GSM522814 ,
GSM522815 ,
GSM522816 ,
GSM522817 ,
GSM522818 ,
GSM522819 ,
GSM522820 ,
GSM522821 ,
GSM522822 ,
GSM522823 ,
GSM522824 ,
GSM522825 ,
GSM522826 ,
GSM522827 ,
GSM522828 ,
GSM522829 ,
GSM522830 ,
GSM522831 ,
GSM522832 ,
GSM522833 ,
GSM522834 ,
GSM522835 ,
GSM522836 ,
GSM522837 ,
GSM522838 ,
GSM522839 ,
GSM522840 ,
GSM522841 ,
GSM522842 ,
GSM522843 ,
GSM522844 ,
GSM522845 ,
GSM522846 ,
GSM522847 ,
GSM522848 ,
GSM522849 ,
GSM522850 ,
GSM522851 ,
GSM522852 ,
GSM522853 ,
GSM522854 ,
GSM522855 ,
GSM522856 ,
GSM522857 ,
GSM522858 ,
GSM522859 ,
GSM522860 ,
GSM522861 ,
GSM522862 ,
GSM522863 ,
GSM522864 ,
GSM522865 ,
GSM522866 ,
GSM522867 ,
GSM522868 ,
GSM522869 ,
GSM522870 ,
GSM522871 ,
GSM522872 ,
GSM522873 ,
GSM522874 ,
GSM522875 ,
GSM522876 ,
GSM522877 ,
GSM522878 ,
GSM522879 ,
GSM522880 ,
GSM522881 ,
GSM522882 ,
GSM522883 ,
GSM522884 ,
GSM522885 ,
GSM522886 ,
GSM522887 ,
GSM522888 ,
GSM522889 ,
GSM522890 ,
GSM522891 ,
GSM522892 ,
GSM522893 ,
GSM522894 ,
GSM522895 ,
GSM522896 ,
GSM522897 ,
GSM522898 ,
GSM522899 ,
GSM522900 ,
GSM522901 ,
GSM522902 ,
GSM522903 ,
GSM522904 ,
GSM522905 ,
GSM522906 ,
GSM522907 ,
GSM522908 ,
GSM522909 ,
GSM522910 ,
GSM522911 ,
GSM522912 ,
GSM522913 ,
GSM522914 ,
GSM522915 ,
GSM522916 ,
GSM522917 ,
GSM522918 ,
GSM522919 ,
GSM522920 ,
GSM522921 ,
GSM522922 ,
GSM522923 ,
GSM522924 ,
GSM522925 ,
GSM522926 ,
GSM522927 ,
GSM522928 ,
GSM522929 ,
GSM522930 ,
GSM522931 ,
GSM522932 ,
GSM522933 ,
GSM522934 ,
GSM522935 ,
GSM522936 ,
GSM522937 ,
GSM522938 ,
GSM522939 ,
GSM522940 ,
GSM522941 ,
GSM522942 ,
GSM522943 ,
GSM522944 ,
GSM522945 ,
GSM522946 ,
GSM522947 ,
GSM522948 ,
GSM522949 ,
GSM522950 ,
GSM522951 ,
GSM522952 ,
GSM522953 ,
GSM522954 ,
GSM522955 ,
GSM522956 ,
GSM522957 ,
GSM522958 ,
GSM522959 ,
GSM522960 ,
GSM522961 ,
GSM522962 ,
GSM522963 ,
GSM522964 ,
GSM522965 ,
GSM522966 ,
GSM522967 ,
GSM522968 ,
GSM522969 ,
GSM522970 ,
GSM522971 ,
GSM522972 ,
GSM522973 ,
GSM522974 ,
GSM522975 ,
GSM522976 ,
GSM522977 ,
GSM522978 ,
GSM522979 ,
GSM522980 ,
GSM522981 ,
GSM522982 ,
GSM522983 ,
GSM522984 ,
GSM522985 ,
GSM522986 ,
GSM522987 ,
GSM522988 ,
GSM522989 ,
GSM522990 ,
GSM522991 ,
GSM522992 ,
GSM522993 ,
GSM522994 ,
GSM522995 ,
GSM522996 ,
GSM522997 ,
GSM522998 ,
GSM522999 ,
GSM523000 ,
GSM523001 ,
GSM523002 ,
GSM523003 ,
GSM523004 ,
GSM523005 ,
GSM523006 ,
GSM523007 ,
GSM523008 ,
GSM523009 ,
GSM523010 ,
GSM523011 ,
GSM523012 ,
GSM523013 ,
GSM523014 ,
GSM523015 ,
GSM523016 ,
GSM523017 ,
GSM523018 ,
GSM523019 ,
GSM523020 ,
GSM523021 ,
GSM523022 ,
GSM757165 ,
GSM757166 ,
GSM757167 ,
GSM757168 ,
GSM757169 ,
GSM757170 ,
GSM757171 ,
GSM757172 ,
GSM757173 ,
GSM757174 ,
GSM757175 ,
GSM757176 ,
GSM757177 ,
GSM757178 ,
GSM757179 ,
GSM757180 ,
GSM757181 ,
GSM757182 ,
GSM757183 ,
GSM757184 ,
GSM757185 ,
GSM757186 ,
GSM757187 ,
GSM757188 ,
GSM757189 ,
GSM757190 ,
GSM757191 ,
GSM757192 ,
GSM757193 ,
GSM757194 ,
GSM757195 ,
GSM757196 ,
GSM757197 ,
GSM757198 ,
GSM757199 ,
GSM757200 ,
GSM757201 ,
GSM757202 ,
GSM757203 ,
GSM757204 ,
GSM757205 ,
GSM757206 ,
GSM757207 ,
GSM757208 ,
GSM757209 ,
GSM757210 ,
GSM757211 ,
GSM757212 ,
GSM757213 ,
GSM757214 ,
GSM757215 ,
GSM757216 ,
GSM757217 ,
GSM757218 ,
GSM757219 ,
GSM757220 ,
GSM757221 ,
GSM757222 ,
GSM757223 ,
GSM757224 ,
GSM757225 ,
GSM757226 ,
GSM757227 ,
GSM757228 ,
GSM757229 ,
GSM757230 ,
GSM757231 ,
GSM757232 ,
GSM757233 ,
GSM757234 ,
GSM757235 ,
GSM757236 ,
GSM757237 ,
GSM757238 ,
GSM757239 ,
GSM757240 ,
GSM757241 ,
GSM757242 ,
GSM757243 ,
GSM757244 ,
GSM757245 ,
GSM757246 ,
GSM757247 ,
GSM757248 ,
GSM757249 ,
GSM757250 ,
GSM757251 ,
GSM757252 ,
GSM757253 ,
GSM757254 ,
GSM757255 ,
GSM757256 ,
GSM757257 ,
GSM757258 ...
Accession list truncated, click here to browse through all related public accessions You can also download a list of all accessions here Series (4)
GSE13305 Molecular mechanisms underlying the metabolic changes induced by the Pro12Ala PPARĪ³2 variant in mice
GSE20902 Affymetrix Mouse liver gene expression profiling of Cross B6/J x A/J
GSE20903 Mouse liver gene expression profiling of Cross B6/J x A/J
GSE30534 Expression of obese mice subjected to diet induced weight loss for 60 days
Relations Alternative to
GPL1261
Data table header descriptions ID Rosetta generated unique probe identifier
EntrezGeneID Entrez Gene identifier for the gene represented
GeneSymbol Gene symbol for the gene represented
GB_ACC GenBank Accession
PROBE_DERIVED_FROM_TRANSCRIPT Actual transcript sequence from which the probe was derived
SPOT_ID RosettaGeneModelID Rosetta internal gene identifier.
ORF Entrez Gene identifier for the gene represented
Data table ID EntrezGeneID GeneSymbol GB_ACC PROBE_DERIVED_FROM_TRANSCRIPT SPOT_ID RosettaGeneModelID ORF 100022486_TGI_at
74316
Isca2
AK002936 AK002936
MMG00277855
74316 100024451_TGI_at
170718
Idh3b
NM_130884 NM_130884
MMG00207231
170718 100024697_TGI_at
BG069043 BG069043
MMG00281011
100022308_TGI_at
223665
C030006K11Rik
NM_176828 NM_176828
MMG00280790
223665 100011044_TGI_at
72123
2010109K11Rik
AK171109 AK171109
MMG00277502
72123 100032726_TGI_at
76380
Ccdc46
NM_029606 NM_029606
MMG00267805
76380 100026887_TGI_at
65971
1700021K02Rik
NM_001017419 NM_001017419
MMG00249803
65971 100029065_TGI_at
68371
Pbld
NM_026701 NM_026701
MMG00249103
68371 100016583_TGI_at
70361
Lman1
AK151599 AK151599
MMG00294995
70361 100017434_TGI_at
BG067974 BG067974
MMG00200358
100003726_TGI_at
212647
Aldh4a1
AK044712 AK044712
MMG00223890
212647 100028612_TGI_at
15494
Hsd3b3
NM_001012306 NM_001012306
MMG00217200
15494 100033222_TGI_at
AK086356 AK086356
MMG00277541
100006070_TGI_at
233529
Kctd14
BY531646 BY531646
MMG00300441
233529 100021443_TGI_at
22724
Zbtb7b
AK171443 AK171443
MMG00215384
22724 100017581_TGI_at
212541
Rho
AK044333 AK044333
MMG00320294
212541 100019227_TGI_at
BG069117 BG069117
MMG00359255
100003389_TGI_at
66854
Trim35
AK020775 AK020775
MMG00273642
66854 100017973_TGI_at
69389
1700014N06Rik
non-public
ENSEMBLE: ENSMUST00000059808
MMG00220311
69389 100010378_TGI_at
19211
Pten
AK088717 AK088717
MMG00297545
19211
32640 2203 Kbytes .Supplementary file Size Download File type/resource GPL7368_Mm_RSTA.CDF.gz
9.2 Mb
(ftp) (http) CDF
Less...
More...