| Submitter | | Handle | SC_SNP | | Submitter SNP ID | chr1.NT_077944.1_170601 | | RefSNP(rs#) | rs878998145 | | Submitted Batch ID | CHR20_NA11321_200306 | | Submitted Date | Jul 14, 2003 | | Publication Cited | [1] A linkage disequilibrium map of human chromosome 20
[2] SNPs detected by comparing chromosome and DNA specific sequences to NCBI Genomic Reference Sequence using SsahaSNP
[3] SSAHA: A Fast Search Method for Large DNA Databases | | First entry to dbSNP | Jul 14 2003 12:00:00:000AM |
| | Resource Links | | GenBank Accession | NT_077944
| | Submitted Gene Name | N.D | | Submitted Gene ID | N.D. | | Submitted SNP Synonyms | N.D | | Submitted linkout | N.D |
| | Assay | | Species | Homo sapiens | Molecular
Type | Genomic | | Method | CHR20_NA11321_200306 | | Ascertainment Samplesize | 2 | | Population | N.D. |
| | Allele | | Observed Allele | A/C | | Ancestral Allele | N.D. | | Allele Origin | N/A | | SNP Class | SNV | | CpG Code | Unknown |
| | | Variation | | Frequency Submission | N.D. | | Genotype Summary | N.D. | | Genotype Submission | N.D. | | Haplotype | N.D. |
|
| Comment | | sequence:Chr_20-47841153e04.p1kposition:148quality:40 |
>gnl|dbSNP|ss12568737|allelePos=2742|len=3836|taxid=9606|alleles='A/C'|mol=Genomic TGCaatggaa tggagaggaa tggaatggaa actaccagaa tggaatggaa tgtaaaggag
tgtaagggaa ttgaatagaa tCAATCCGAA TGTaatggaa tggaatggaa cggaatggaa
tggaatggaa tggaatggaa tggaatcacc ccgagtgcaa tcgaatggaa tcgaatggaa
tgcaatgcaa tggaatggat tcaacttgaa tggaatggaa agaatgcaat caacacgagt
ggaatggcat ggattggaat ggaatggaat ggaatCAACC CGAGTACAGG ggaatggaat
ggaatggaat gcaatggaat ggaatcatcc gtattggaat ggaaaggaat ggaatggaat
ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat ggaatcaact cgattgcaat cgaatggaat
ggaatggaat taacccaaat agaatggaat ggaatggaat ggaacggaac ggaatggaat
ggaatggaac ggaacggaac ggaacagaac ggaacggaac ggaatggaat ggaatggaat
ggaatggaat CAACGCGAGT GCAGGggaat ggaatggaat ggaattcaat ggaatggaat
cttccgcaat ggaatggaat ggaatggtat ggaatggaat ggaatggtac ggaatagaat
ggaatggaac gaattgtaat ggaatggaat tgaatggaat ggaatggaat ggaatggaat
ggaatggaat CACCGCGAGT GCAGGggaat gtaatggaac ggaatgcaat ggaatggaat
catccggaat ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat caacccgagt
gcaatggaat ggagtggaat ggaatggaat ggaatggaac aacccgaatg gaatggaatg
taatggaGAG Taagggagtt gaatagaatc aatccgaatg taatggaatg gaatgcaacg
gaatggaatg gaatggaatg gaatggaatg caatggaatg gaatcaaccc gagtacaatg
gaatggaatg gaatggaatg gaatggaatg gaatggaatg gaatggaatg atacggaata
gaatggaatg gaacgaaatg gaattgaatg gaatggagga atggaatgga atggaatgga
atggaatcgt tccgagtgga ataggaggga aagtattcga gtggaatgga atggaaagaa
atCAACAAga gtggaatgga atgacatgga ttggaatgga atggaatgga atcaacccga
gtacagggga atggaatgga atggaatgca atggaatgga atcatccgta atggaatgga
aaggaatgga atggaatgga atggaatgga atggaatgga atcaactcga ttgcaatcga
atggaatgga atggaattaa cccgaataga atggaatgga atggaatgga acggaacgga
atggaatgga atggaatgga aaggaacgga aaggaaggga atggaatgga atagaatgga
atggaatgga atcaacgcga gtgcagggga atggaatgga acggaatgca atggaatgga
atCTTCCGGA ATGgaatgga atggaatgga atggaatgga atggaatcaa cccgagtgca
atggaatgga gtggaatgga acggaatgga atggaacaac ccgaatggaa tggaatataa
tggagagtaa gggagttgaa tagaatcaat ccgaatgtaa tggaatggaa tggaacggaa
tggaattgaa tggaatggaa tggaatgCAA TGGAATGGAA TCAACCCGAG TGCaatggaa
tggagaggaa tggaatggaa tggaatggaa actacccgaa tggaatggaa tgtaatggag
tgtaagggaa ttgaatagaa tcaatccgaa tgtaatggaa tggaatggaa cggaatggaa
tggaatggaa tggaatggaa tggaatggaa tggaatgcaa tggaatggaa tcaacccgag
tgcaatcgaa tggaatcgaa tggaatggaa tgaaatggaa tggaatcaac ttgaatggaa
tggaaagaat ggaatcaaca cgagtggaat ggcatggatt ggaatggaat ggaatggaat
caacccgagt acaggggaat ggaatagaat ggaatgcaat ggaatggaat CATCCGTAAT
GGAATGGAAA Ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat taacccgaat
acaatggaat ggaatggaat ggaatggaat ggaggggaat ggaatggaat caaccggagt
gcaggggaat ggaatggaat ggaatgcaat ggaatggaat catccggaat ggaatggaat
ggaatggaat gCAAAGCAAT GGAATCAACT CGATTGCAGt ggaatggaat ggaatggaaa
ggaatacatt ggaatCAACC Cgagtggaat ggaatgcaaa ggactggaat ggagtggaat
gtaatggaat gcaatggaat ggaatggaat ggaatcaact tgattggaat ggaatggaat
ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat caacccgact gcaggggaat ggaatggaat
ggaatgcaat ggaatggaTT CAACTTgaat ggaatggaaa gaatggaatc aacacgagtg
gaatggcatg gattggaatg gaatggaatg gaatcaaccc gagtacaggg gaatggaatg
gaatggaatg caatggaatg gaatcatccg taatggaatg g
M
aaggaatgga atggaatgga atggaatgga atggaatgga atggaatgga atcaactcga
ttgcaatcga atggaatgga atggaattaa cccgaataga atggaatgga atggaatgga
atggaacgga acggaatgga atgcaatgga atggaacgga acggaatgga atggaatgga
atggaatgga atcaacgcga gtgcagggga atggaatgga atggaatgca atggaatgga
aacttccgga atggaatgga atggaatgga atggaatgaa atgCAATGGA TTCAACTCGA
TTGCaatgga atggaataga atggaatgaa atggaatgga atgcaattaa tccgaataga
atggaatgga atggaatgga acggaatgga acggaatgga atggaatgga atggaatgga
atggtatgga atggaatgga atggtacgga atagaatgga atggaacgaa ttgtaatgga
atggaattga atggaatgga atggaatgga atggaatcaa cgcgagtgca ggggaatgta
atggaacgga atgcaatgga atggaatcat ccggaatgga atggaatgga atggaatgga
atggaatcaa cccgagtgca atggaatgga gtggaatgga atggaatgga atggaaCAAC
CCgaatggaa tggaatgtaa tggagagtaa gggagttgaa tagaatcaat ccgaatgtaa
tggaatggaa tgCAACGgaa tggaatggaa tggaatggaa tggaatgcaa tggaatggaa
tcaacccgag tacaatggaa tggaatggat ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat
ggaatgatac ggaatagaat ggaatggaac gaaatggaat tgaatggaaa ggaatggaat
ggaatggaat ggaatCGTTC CGAGTGGAAT AGGAGGGAAA GTATTCgagt ggaatggaaa
ggaatggaat caaccagagt ggaatggaag ggaatggaat ggaatggaaa ctaatagaat
ggaatcaacc cgagtggaat ggaatggaaa ggactggaat ggaatggaat ggaatggaat
CAACTCGTTT GTAA
There is no frequency submission for ss12568737.
No sufficient data to compute Hardy-weinberg probability for ss12568737.
There is no individual genotype data for ss12568737.
| 
